Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms