Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mfsd4aQ6PDC8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mfsd4aQ6PDC8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms