Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms