Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6PD19 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6PD19 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q6PD19 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q6PD19 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6PD19 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6PD19 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6PD19 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6PD19 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q6PD19 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q6PD19 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q6PD19 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Q6PD19 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q6PD19 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms