Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Herc4Q6PAV2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms