Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp49Q6P9L4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms