Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C7

Znf728, Zinc finger protein 728, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf728Q6P5C7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf728Q6P5C7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Znf728Q6P5C7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Znf728Q6P5C7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf728Q6P5C7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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