Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp200Q6P4T2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms