Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Podnl1Q6P3Y9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms