Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hdac10Q6P3E7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms