Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BckdhbQ6P3A8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BckdhbQ6P3A8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms