Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Frg2f1Q6P3A2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Frg2f1Q6P3A2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms