Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casc4Q6P2L7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms