Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kdm2bQ6P1G2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Kdm2bQ6P1G2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms