Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Soga3Q6NZL0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms