Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms