Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Frem2Q6NVD0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frem2Q6NVD0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms