Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ltv1Q6NSQ7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms