Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdcd11Q6NS46 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pdcd11Q6NS46 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms