Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tpm4Q6IRU2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tpm4Q6IRU2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms