Protein–RNA interactions for Protein: Q6IME9

Krt72, Keratin, type II cytoskeletal 72, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt72Q6IME9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krt72Q6IME9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms