Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms