Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Smarca2Q6DIC0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Smarca2Q6DIC0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms