Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms