Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cep290Q6A078 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Cep290Q6A078 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Cep290Q6A078 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cep290Q6A078 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms