Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sv2cQ69ZS6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms