Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Pdzrn3Q69ZS0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdzrn3Q69ZS0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Pdzrn3Q69ZS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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