Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sbno1Q689Z5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sbno1Q689Z5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms