Protein–RNA interactions for Protein: Q64704

Stx3, Syntaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx3Q64704 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Stx3Q64704 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stx3Q64704 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms