Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PatjQ63ZW7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms