Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zic2Q62520 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Zic2Q62520 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms