Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Epha6Q62413 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Epha6Q62413 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Epha6Q62413 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms