Protein–RNA interactions for Protein: Q62348

Tsn, Translin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsnQ62348 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TsnQ62348 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TsnQ62348 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms