Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ss18Q62280 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms