Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SypQ62277 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SypQ62277 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SypQ62277 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SypQ62277 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SypQ62277 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms