Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sprr1bQ62267 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms