Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sema5aQ62217 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms