Protein–RNA interactions for Protein: Q62159

Rhoc, Rho-related GTP-binding protein RhoC, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhocQ62159 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RhocQ62159 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RhocQ62159 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms