Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Phox2aQ62066 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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