Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Odf1Q61999 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Odf1Q61999 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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