Protein–RNA interactions for Protein: Q61985

Nfe2l1, Endoplasmic reticulum membrane sensor NFE2L1, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l1Q61985 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nfe2l1Q61985 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Nfe2l1Q61985 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms