Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rai1Q61818 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms