Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ifi47Q61635 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifi47Q61635 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms