Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxd1Q61345 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms