Protein–RNA interactions for Protein: Q61233

Lcp1, Plastin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcp1Q61233 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lcp1Q61233 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lcp1Q61233 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms