Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trpc6Q61143 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms