Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Usf1Q61069 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Usf1Q61069 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms