Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NinQ61043 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NinQ61043 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NinQ61043 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NinQ61043 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NinQ61043 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NinQ61043 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms