Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf8Q60846 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf8Q60846 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms