Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cdkn2cQ60772 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms